Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap5b1Q3TAP4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms