Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms