Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr27Q3SYJ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms