Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms