Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riiad1Q3KNY5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms