Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms