Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms