Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpusd2Q149F1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms