Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms