Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cpne7Q0VE82 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms