Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms