Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms