Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm1Q0GA42 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms