Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms