Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms