Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms