Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou6f1Q07916 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms