Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MestQ07646 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MestQ07646 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MestQ07646 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MestQ07646 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms