Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms