Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms