Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nfe2Q07279 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nfe2Q07279 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms