Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms