Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnal1Q05A62 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms