Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms