Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fmn1Q05860 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fmn1Q05860 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms