Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms