Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms