Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms