Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnb1Q03717 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms