Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms