Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms