Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RykQ01887 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RykQ01887 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RykQ01887 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RykQ01887 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms