Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms