Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col1a2Q01149 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms