Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SeleQ00690 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms