Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb4P99026 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms