Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shc1P98083 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shc1P98083 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms