Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfcP97953 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfcP97953 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms