Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Brca2P97929 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brca2P97929 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms