Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smn1P97801 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smn1P97801 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms