Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms