Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg1P97376 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms