Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim43bP86448 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms