Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx1P81068 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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