Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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