Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms