Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms