Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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