Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms