Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms